Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM200BP0CF97 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM200BP0CF97 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAM200BP0CF97 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM200BP0CF97 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM200BP0CF97 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FAM200BP0CF97 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM200BP0CF97 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM200BP0CF97 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms