Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FREM3P0C091 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FREM3P0C091 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FREM3P0C091 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FREM3P0C091 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FREM3P0C091 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FREM3P0C091 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms