Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPSAP08865 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPSAP08865 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPSAP08865 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPSAP08865 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPSAP08865 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPSAP08865 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPSAP08865 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPSAP08865 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPSAP08865 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPSAP08865 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPSAP08865 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPSAP08865 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPSAP08865 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPSAP08865 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPSAP08865 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPSAP08865 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPSAP08865 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPSAP08865 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPSAP08865 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPSAP08865 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPSAP08865 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPSAP08865 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPSAP08865 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPSAP08865 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPSAP08865 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPSAP08865 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPSAP08865 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RPSAP08865 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPSAP08865 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPSAP08865 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPSAP08865 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPSAP08865 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPSAP08865 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPSAP08865 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPSAP08865 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPSAP08865 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPSAP08865 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPSAP08865 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPSAP08865 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPSAP08865 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPSAP08865 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPSAP08865 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPSAP08865 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPSAP08865 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPSAP08865 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPSAP08865 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPSAP08865 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPSAP08865 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPSAP08865 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPSAP08865 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPSAP08865 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPSAP08865 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPSAP08865 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPSAP08865 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPSAP08865 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPSAP08865 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPSAP08865 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPSAP08865 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPSAP08865 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPSAP08865 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPSAP08865 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPSAP08865 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPSAP08865 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPSAP08865 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPSAP08865 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPSAP08865 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPSAP08865 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPSAP08865 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPSAP08865 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPSAP08865 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPSAP08865 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPSAP08865 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPSAP08865 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPSAP08865 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPSAP08865 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPSAP08865 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPSAP08865 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPSAP08865 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPSAP08865 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPSAP08865 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPSAP08865 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPSAP08865 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPSAP08865 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPSAP08865 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPSAP08865 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPSAP08865 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPSAP08865 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPSAP08865 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPSAP08865 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPSAP08865 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPSAP08865 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPSAP08865 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPSAP08865 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPSAP08865 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPSAP08865 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPSAP08865 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPSAP08865 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPSAP08865 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPSAP08865 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms