Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IL3P08700 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL3P08700 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL3P08700 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL3P08700 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL3P08700 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IL3P08700 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IL3P08700 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IL3P08700 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IL3P08700 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IL3P08700 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IL3P08700 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IL3P08700 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IL3P08700 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IL3P08700 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IL3P08700 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IL3P08700 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL3P08700 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL3P08700 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL3P08700 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IL3P08700 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IL3P08700 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IL3P08700 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IL3P08700 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL3P08700 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IL3P08700 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL3P08700 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IL3P08700 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IL3P08700 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IL3P08700 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL3P08700 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL3P08700 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL3P08700 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL3P08700 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL3P08700 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IL3P08700 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL3P08700 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL3P08700 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL3P08700 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL3P08700 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL3P08700 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL3P08700 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL3P08700 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL3P08700 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL3P08700 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IL3P08700 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL3P08700 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL3P08700 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL3P08700 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL3P08700 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL3P08700 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL3P08700 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL3P08700 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IL3P08700 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IL3P08700 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IL3P08700 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IL3P08700 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IL3P08700 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IL3P08700 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL3P08700 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL3P08700 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL3P08700 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL3P08700 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IL3P08700 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IL3P08700 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL3P08700 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL3P08700 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IL3P08700 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IL3P08700 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IL3P08700 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IL3P08700 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IL3P08700 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IL3P08700 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IL3P08700 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IL3P08700 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IL3P08700 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IL3P08700 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IL3P08700 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IL3P08700 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IL3P08700 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IL3P08700 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IL3P08700 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IL3P08700 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IL3P08700 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IL3P08700 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IL3P08700 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IL3P08700 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IL3P08700 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IL3P08700 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IL3P08700 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IL3P08700 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IL3P08700 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IL3P08700 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IL3P08700 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IL3P08700 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IL3P08700 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IL3P08700 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IL3P08700 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IL3P08700 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IL3P08700 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms