Protein–RNA interactions for Protein: P04798

CYP1A1, Cytochrome P450 1A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP1A1P04798 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP1A1P04798 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP1A1P04798 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP1A1P04798 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP1A1P04798 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP1A1P04798 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP1A1P04798 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP1A1P04798 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP1A1P04798 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP1A1P04798 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP1A1P04798 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP1A1P04798 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP1A1P04798 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP1A1P04798 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP1A1P04798 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP1A1P04798 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP1A1P04798 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms