Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPSP04118 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPSP04118 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPSP04118 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPSP04118 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPSP04118 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPSP04118 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLPSP04118 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPSP04118 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPSP04118 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPSP04118 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPSP04118 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLPSP04118 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPSP04118 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLPSP04118 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPSP04118 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLPSP04118 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPSP04118 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLPSP04118 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLPSP04118 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLPSP04118 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLPSP04118 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLPSP04118 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPSP04118 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPSP04118 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLPSP04118 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPSP04118 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPSP04118 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPSP04118 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPSP04118 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPSP04118 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLPSP04118 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPSP04118 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLPSP04118 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPSP04118 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLPSP04118 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLPSP04118 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLPSP04118 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLPSP04118 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLPSP04118 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLPSP04118 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPSP04118 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPSP04118 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPSP04118 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLPSP04118 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPSP04118 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPSP04118 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLPSP04118 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLPSP04118 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPSP04118 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPSP04118 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPSP04118 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLPSP04118 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPSP04118 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPSP04118 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPSP04118 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLPSP04118 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLPSP04118 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLPSP04118 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPSP04118 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPSP04118 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLPSP04118 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLPSP04118 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLPSP04118 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLPSP04118 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CLPSP04118 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLPSP04118 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLPSP04118 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPSP04118 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLPSP04118 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPSP04118 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPSP04118 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLPSP04118 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPSP04118 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPSP04118 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPSP04118 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPSP04118 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPSP04118 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLPSP04118 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLPSP04118 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLPSP04118 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLPSP04118 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPSP04118 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLPSP04118 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPSP04118 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPSP04118 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLPSP04118 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLPSP04118 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPSP04118 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPSP04118 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPSP04118 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPSP04118 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPSP04118 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLPSP04118 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPSP04118 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPSP04118 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPSP04118 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPSP04118 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLPSP04118 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLPSP04118 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.1 ms