Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A1P02730 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A1P02730 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A1P02730 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A1P02730 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A1P02730 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A1P02730 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A1P02730 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A1P02730 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A1P02730 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A1P02730 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A1P02730 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A1P02730 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A1P02730 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A1P02730 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms