Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC1P02654 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC1P02654 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC1P02654 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC1P02654 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC1P02654 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC1P02654 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC1P02654 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC1P02654 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC1P02654 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC1P02654 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC1P02654 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC1P02654 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC1P02654 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC1P02654 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC1P02654 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC1P02654 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC1P02654 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC1P02654 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC1P02654 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC1P02654 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC1P02654 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC1P02654 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC1P02654 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC1P02654 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC1P02654 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC1P02654 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC1P02654 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC1P02654 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC1P02654 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC1P02654 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC1P02654 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC1P02654 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC1P02654 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC1P02654 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC1P02654 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC1P02654 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC1P02654 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC1P02654 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC1P02654 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC1P02654 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC1P02654 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC1P02654 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOC1P02654 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOC1P02654 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC1P02654 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC1P02654 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC1P02654 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC1P02654 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC1P02654 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC1P02654 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC1P02654 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC1P02654 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC1P02654 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC1P02654 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOC1P02654 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOC1P02654 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC1P02654 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC1P02654 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC1P02654 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC1P02654 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC1P02654 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC1P02654 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC1P02654 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC1P02654 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC1P02654 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC1P02654 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC1P02654 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC1P02654 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC1P02654 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC1P02654 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC1P02654 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC1P02654 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC1P02654 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC1P02654 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC1P02654 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC1P02654 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC1P02654 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC1P02654 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC1P02654 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC1P02654 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC1P02654 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC1P02654 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC1P02654 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC1P02654 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC1P02654 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC1P02654 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC1P02654 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOC1P02654 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APOC1P02654 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC1P02654 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC1P02654 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC1P02654 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC1P02654 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC1P02654 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC1P02654 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOC1P02654 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC1P02654 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC1P02654 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC1P02654 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms