Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA2P02652 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA2P02652 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA2P02652 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA2P02652 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA2P02652 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA2P02652 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA2P02652 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA2P02652 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA2P02652 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA2P02652 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA2P02652 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA2P02652 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA2P02652 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA2P02652 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA2P02652 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA2P02652 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA2P02652 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA2P02652 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA2P02652 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA2P02652 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA2P02652 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA2P02652 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA2P02652 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA2P02652 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA2P02652 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA2P02652 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA2P02652 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA2P02652 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOA2P02652 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA2P02652 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA2P02652 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA2P02652 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA2P02652 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA2P02652 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA2P02652 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA2P02652 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA2P02652 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA2P02652 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA2P02652 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA2P02652 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA2P02652 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA2P02652 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA2P02652 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA2P02652 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA2P02652 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA2P02652 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA2P02652 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA2P02652 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOA2P02652 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOA2P02652 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA2P02652 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA2P02652 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA2P02652 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA2P02652 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA2P02652 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA2P02652 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA2P02652 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA2P02652 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA2P02652 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA2P02652 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA2P02652 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA2P02652 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA2P02652 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA2P02652 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA2P02652 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA2P02652 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA2P02652 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA2P02652 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA2P02652 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA2P02652 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA2P02652 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA2P02652 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA2P02652 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA2P02652 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA2P02652 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA2P02652 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA2P02652 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA2P02652 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA2P02652 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA2P02652 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA2P02652 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA2P02652 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA2P02652 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA2P02652 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA2P02652 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA2P02652 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA2P02652 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA2P02652 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA2P02652 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA2P02652 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA2P02652 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA2P02652 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA2P02652 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA2P02652 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA2P02652 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA2P02652 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA2P02652 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APOA2P02652 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA2P02652 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms