Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
APOEP02649 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOEP02649 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOEP02649 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOEP02649 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOEP02649 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APOEP02649 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOEP02649 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOEP02649 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOEP02649 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
APOEP02649 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOEP02649 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOEP02649 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOEP02649 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOEP02649 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
APOEP02649 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOEP02649 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOEP02649 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOEP02649 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOEP02649 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOEP02649 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOEP02649 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOEP02649 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
APOEP02649 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOEP02649 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOEP02649 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOEP02649 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOEP02649 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOEP02649 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
APOEP02649 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOEP02649 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOEP02649 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOEP02649 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOEP02649 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOEP02649 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOEP02649 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOEP02649 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOEP02649 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOEP02649 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOEP02649 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOEP02649 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOEP02649 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOEP02649 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOEP02649 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOEP02649 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOEP02649 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOEP02649 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOEP02649 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOEP02649 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOEP02649 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOEP02649 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOEP02649 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOEP02649 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOEP02649 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOEP02649 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
APOEP02649 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
APOEP02649 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOEP02649 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOEP02649 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOEP02649 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOEP02649 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOEP02649 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOEP02649 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOEP02649 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOEP02649 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOEP02649 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOEP02649 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOEP02649 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOEP02649 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOEP02649 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOEP02649 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOEP02649 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOEP02649 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APOEP02649 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOEP02649 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOEP02649 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOEP02649 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOEP02649 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
APOEP02649 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
APOEP02649 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOEP02649 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
APOEP02649 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOEP02649 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOEP02649 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
APOEP02649 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOEP02649 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOEP02649 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.54■■■□□ 2
APOEP02649 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOEP02649 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOEP02649 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.53■■■□□ 2
APOEP02649 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOEP02649 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOEP02649 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOEP02649 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOEP02649 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOEP02649 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOEP02649 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOEP02649 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOEP02649 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOEP02649 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1401.2 ms