Protein–RNA interactions for Protein: P01817

IGHV2-5, Immunoglobulin heavy variable 2-5, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-5P01817 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV2-5P01817 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV2-5P01817 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV2-5P01817 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV2-5P01817 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV2-5P01817 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGHV2-5P01817 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV2-5P01817 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV2-5P01817 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV2-5P01817 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV2-5P01817 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms