Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV3-9P01782 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGHV3-9P01782 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGHV3-9P01782 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV3-9P01782 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGHV3-9P01782 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms