Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALCAP01258 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALCAP01258 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALCAP01258 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALCAP01258 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALCAP01258 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALCAP01258 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALCAP01258 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALCAP01258 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALCAP01258 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALCAP01258 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALCAP01258 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALCAP01258 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALCAP01258 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALCAP01258 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALCAP01258 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALCAP01258 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALCAP01258 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALCAP01258 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALCAP01258 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALCAP01258 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CALCAP01258 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALCAP01258 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALCAP01258 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALCAP01258 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALCAP01258 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALCAP01258 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALCAP01258 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALCAP01258 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALCAP01258 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALCAP01258 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALCAP01258 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALCAP01258 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALCAP01258 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALCAP01258 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALCAP01258 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALCAP01258 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALCAP01258 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALCAP01258 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALCAP01258 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALCAP01258 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CALCAP01258 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALCAP01258 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALCAP01258 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALCAP01258 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALCAP01258 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCAP01258 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCAP01258 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCAP01258 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCAP01258 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCAP01258 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCAP01258 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCAP01258 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCAP01258 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCAP01258 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCAP01258 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCAP01258 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCAP01258 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCAP01258 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCAP01258 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCAP01258 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALCAP01258 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALCAP01258 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALCAP01258 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CALCAP01258 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALCAP01258 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALCAP01258 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALCAP01258 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALCAP01258 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CALCAP01258 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CALCAP01258 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALCAP01258 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALCAP01258 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALCAP01258 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCAP01258 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCAP01258 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCAP01258 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCAP01258 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCAP01258 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALCAP01258 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALCAP01258 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALCAP01258 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALCAP01258 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALCAP01258 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CALCAP01258 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALCAP01258 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALCAP01258 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALCAP01258 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALCAP01258 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALCAP01258 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCAP01258 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALCAP01258 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALCAP01258 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALCAP01258 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CALCAP01258 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms