Protein–RNA interactions for Protein: O95755

RAB36, Ras-related protein Rab-36, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB36O95755 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB36O95755 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB36O95755 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB36O95755 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB36O95755 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB36O95755 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB36O95755 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB36O95755 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB36O95755 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB36O95755 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB36O95755 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB36O95755 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB36O95755 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB36O95755 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB36O95755 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB36O95755 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB36O95755 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB36O95755 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB36O95755 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB36O95755 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB36O95755 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB36O95755 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB36O95755 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB36O95755 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB36O95755 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB36O95755 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB36O95755 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB36O95755 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB36O95755 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB36O95755 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB36O95755 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB36O95755 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB36O95755 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB36O95755 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB36O95755 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB36O95755 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB36O95755 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB36O95755 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB36O95755 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB36O95755 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB36O95755 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB36O95755 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB36O95755 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB36O95755 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB36O95755 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB36O95755 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB36O95755 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB36O95755 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB36O95755 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB36O95755 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB36O95755 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB36O95755 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB36O95755 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB36O95755 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB36O95755 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB36O95755 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB36O95755 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB36O95755 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB36O95755 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB36O95755 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB36O95755 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB36O95755 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB36O95755 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB36O95755 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB36O95755 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB36O95755 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB36O95755 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB36O95755 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB36O95755 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB36O95755 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB36O95755 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB36O95755 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB36O95755 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB36O95755 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB36O95755 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB36O95755 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB36O95755 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB36O95755 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB36O95755 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB36O95755 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB36O95755 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB36O95755 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB36O95755 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB36O95755 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB36O95755 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB36O95755 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB36O95755 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB36O95755 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB36O95755 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB36O95755 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB36O95755 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB36O95755 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB36O95755 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB36O95755 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB36O95755 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB36O95755 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB36O95755 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB36O95755 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB36O95755 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB36O95755 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms