Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPP2O95045 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UPP2O95045 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UPP2O95045 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UPP2O95045 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
UPP2O95045 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPP2O95045 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPP2O95045 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPP2O95045 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPP2O95045 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPP2O95045 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPP2O95045 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UPP2O95045 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPP2O95045 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPP2O95045 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UPP2O95045 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UPP2O95045 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
UPP2O95045 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UPP2O95045 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPP2O95045 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPP2O95045 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UPP2O95045 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UPP2O95045 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UPP2O95045 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UPP2O95045 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPP2O95045 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPP2O95045 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPP2O95045 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPP2O95045 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
UPP2O95045 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPP2O95045 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
UPP2O95045 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UPP2O95045 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPP2O95045 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPP2O95045 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UPP2O95045 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
UPP2O95045 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UPP2O95045 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UPP2O95045 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPP2O95045 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPP2O95045 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPP2O95045 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPP2O95045 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPP2O95045 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UPP2O95045 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UPP2O95045 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UPP2O95045 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPP2O95045 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UPP2O95045 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPP2O95045 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPP2O95045 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPP2O95045 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPP2O95045 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPP2O95045 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPP2O95045 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPP2O95045 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
UPP2O95045 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPP2O95045 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPP2O95045 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
UPP2O95045 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UPP2O95045 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UPP2O95045 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UPP2O95045 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UPP2O95045 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPP2O95045 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPP2O95045 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPP2O95045 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPP2O95045 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPP2O95045 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
UPP2O95045 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
UPP2O95045 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
UPP2O95045 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UPP2O95045 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UPP2O95045 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPP2O95045 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UPP2O95045 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPP2O95045 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
UPP2O95045 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPP2O95045 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPP2O95045 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UPP2O95045 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UPP2O95045 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPP2O95045 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPP2O95045 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UPP2O95045 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPP2O95045 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UPP2O95045 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UPP2O95045 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UPP2O95045 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UPP2O95045 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UPP2O95045 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UPP2O95045 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPP2O95045 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPP2O95045 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPP2O95045 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPP2O95045 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPP2O95045 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPP2O95045 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPP2O95045 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UPP2O95045 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms