Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24DO94855 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24DO94855 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24DO94855 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24DO94855 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC24DO94855 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24DO94855 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24DO94855 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC24DO94855 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24DO94855 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC24DO94855 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24DO94855 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24DO94855 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC24DO94855 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24DO94855 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC24DO94855 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24DO94855 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24DO94855 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms