Protein–RNA interactions for Protein: O75674

TOM1L1, TOM1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L1O75674 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOM1L1O75674 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOM1L1O75674 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOM1L1O75674 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOM1L1O75674 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOM1L1O75674 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOM1L1O75674 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOM1L1O75674 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOM1L1O75674 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOM1L1O75674 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOM1L1O75674 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms