Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN5O75503 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN5O75503 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN5O75503 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLN5O75503 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN5O75503 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN5O75503 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN5O75503 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN5O75503 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN5O75503 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN5O75503 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN5O75503 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN5O75503 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN5O75503 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN5O75503 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN5O75503 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN5O75503 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN5O75503 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN5O75503 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN5O75503 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN5O75503 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN5O75503 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN5O75503 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN5O75503 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLN5O75503 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLN5O75503 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLN5O75503 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLN5O75503 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLN5O75503 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLN5O75503 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLN5O75503 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLN5O75503 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLN5O75503 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLN5O75503 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN5O75503 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN5O75503 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN5O75503 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN5O75503 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN5O75503 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN5O75503 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN5O75503 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLN5O75503 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLN5O75503 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN5O75503 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN5O75503 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN5O75503 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN5O75503 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN5O75503 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN5O75503 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN5O75503 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN5O75503 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN5O75503 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN5O75503 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN5O75503 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN5O75503 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN5O75503 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN5O75503 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN5O75503 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLN5O75503 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLN5O75503 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLN5O75503 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLN5O75503 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN5O75503 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN5O75503 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN5O75503 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN5O75503 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN5O75503 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN5O75503 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN5O75503 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN5O75503 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN5O75503 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN5O75503 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLN5O75503 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLN5O75503 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLN5O75503 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN5O75503 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN5O75503 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN5O75503 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN5O75503 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN5O75503 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN5O75503 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN5O75503 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN5O75503 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN5O75503 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN5O75503 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN5O75503 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN5O75503 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN5O75503 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN5O75503 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN5O75503 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLN5O75503 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN5O75503 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN5O75503 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN5O75503 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLN5O75503 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLN5O75503 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN5O75503 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN5O75503 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN5O75503 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLN5O75503 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms