Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC4O75487 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC4O75487 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC4O75487 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC4O75487 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC4O75487 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC4O75487 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPC4O75487 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC4O75487 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC4O75487 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC4O75487 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC4O75487 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPC4O75487 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC4O75487 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC4O75487 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC4O75487 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC4O75487 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC4O75487 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPC4O75487 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC4O75487 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC4O75487 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC4O75487 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC4O75487 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC4O75487 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC4O75487 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC4O75487 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC4O75487 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC4O75487 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC4O75487 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC4O75487 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC4O75487 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC4O75487 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC4O75487 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC4O75487 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC4O75487 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC4O75487 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC4O75487 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC4O75487 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC4O75487 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC4O75487 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC4O75487 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC4O75487 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC4O75487 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC4O75487 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC4O75487 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC4O75487 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC4O75487 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC4O75487 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC4O75487 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC4O75487 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC4O75487 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC4O75487 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC4O75487 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC4O75487 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC4O75487 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC4O75487 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC4O75487 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC4O75487 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC4O75487 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC4O75487 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC4O75487 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC4O75487 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC4O75487 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC4O75487 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC4O75487 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC4O75487 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC4O75487 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC4O75487 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC4O75487 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC4O75487 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC4O75487 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC4O75487 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC4O75487 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC4O75487 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC4O75487 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC4O75487 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC4O75487 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC4O75487 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC4O75487 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC4O75487 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC4O75487 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC4O75487 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC4O75487 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC4O75487 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC4O75487 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPC4O75487 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC4O75487 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC4O75487 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC4O75487 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC4O75487 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC4O75487 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC4O75487 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC4O75487 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC4O75487 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC4O75487 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC4O75487 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC4O75487 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC4O75487 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC4O75487 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC4O75487 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms