Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF254O75437 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF254O75437 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF254O75437 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF254O75437 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF254O75437 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF254O75437 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms