Protein–RNA interactions for Protein: O75382

TRIM3, Tripartite motif-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM3O75382 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM3O75382 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM3O75382 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM3O75382 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM3O75382 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM3O75382 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.5 ms