Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.8□□□□□ -1.321e-20■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-211ENST00000490438 887 ntTSL 215.66■□□□□ 0.11e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-203ENST00000395554 1103 ntTSL 515.08■□□□□ 01e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.151e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.221e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.311e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-204ENST00000430417 414 ntTSL 36.18□□□□□ -1.421e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.15□□□□□ -1.751e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-204ENST00000429589 1005 ntTSL 56.79□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 56.12□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 54.49□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.477e-60■■■■■ 92.3
DKC1O60832 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.091e-20■■■■■ 92.3
DKC1O60832 TBL1X-208ENST00000452824 387 ntTSL 512.87□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 91.5
DKC1O60832 IGF2BP1-203ENST00000499130 568 ntTSL 313.88□□□□□ -0.194e-20■■■■■ 90.1
DKC1O60832 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.33e-39■■■■■ 90.1
DKC1O60832 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 89.9
DKC1O60832 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.836e-21■■■■■ 89.8
DKC1O60832 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 226.81■■□□□ 1.887e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.657e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.297e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 57.7□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 37.7□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 89.1
DKC1O60832 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.512e-26■■■■■ 87.9
DKC1O60832 CDK8-205ENST00000536792 3032 ntTSL 1 (best)17.04■□□□□ 0.322e-26■■■■■ 87.9
DKC1O60832 SLC13A3-203ENST00000372121 848 ntTSL 518.17■□□□□ 0.52e-56■■■■■ 87.3
DKC1O60832 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-56■■■■■ 87.3
DKC1O60832 NRSN2-204ENST00000492242 846 ntTSL 223.61■■□□□ 1.374e-21■■■■■ 86.9
DKC1O60832 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.754e-21■■■■■ 86.9
DKC1O60832 NRSN2-208ENST00000609179 578 ntTSL 317.09■□□□□ 0.334e-21■■■■■ 86.9
DKC1O60832 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.254e-21■■■■■ 86.9
DKC1O60832 NRSN2-209ENST00000609504 582 ntTSL 316.07■□□□□ 0.164e-21■■■■■ 86.9
DKC1O60832 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.074e-21■■■■■ 86.9
DKC1O60832 NRSN2-203ENST00000470439 697 ntTSL 214.32□□□□□ -0.124e-21■■■■■ 86.9
DKC1O60832 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 524.58■■□□□ 1.523e-11■■■■■ 86.3
DKC1O60832 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.333e-11■■■■■ 86.3
DKC1O60832 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 521.96■■□□□ 1.113e-11■■■■■ 86.3
DKC1O60832 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.993e-11■■■■■ 86.3
DKC1O60832 FARSA-210ENST00000593021 1135 ntTSL 521.05■□□□□ 0.963e-11■■■■■ 86.3
DKC1O60832 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.93e-11■■■■■ 86.3
DKC1O60832 FARSA-205ENST00000587488 514 ntTSL 315.59■□□□□ 0.093e-11■■■■■ 86.3
DKC1O60832 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-22■■■■■ 86.3
DKC1O60832 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 411.14□□□□□ -0.631e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 411.14□□□□□ -0.631e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 410.37□□□□□ -0.751e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.831e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 29.56□□□□□ -0.881e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 48.32□□□□□ -1.081e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 28.21□□□□□ -1.11e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 47.96□□□□□ -1.141e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.471e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.971e-323■■■■■ 85
DKC1O60832 SNHG10-203ENST00000554169 981 ntTSL 215.54■□□□□ 0.081e-323■■■■■ 85
DKC1O60832 SNHG10-204ENST00000555866 221 ntTSL 215.27■□□□□ 0.041e-323■■■■■ 85
DKC1O60832 SNHG10-202ENST00000553559 428 ntTSL 314.97□□□□□ -0.011e-323■■■■■ 85
DKC1O60832 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.25□□□□□ -1.891e-323■■■■■ 85
DKC1O60832 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.736e-7■■■■■ 84.5
DKC1O60832 MC1R-201ENST00000539976 2464 ntTSL 514.38□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 84.3
DKC1O60832 PHB2-208ENST00000543465 1518 ntTSL 525.12■■□□□ 1.611e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.281e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.221e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.981e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.961e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.821e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-205ENST00000537646 874 ntTSL 517.07■□□□□ 0.321e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.111e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-212ENST00000545555 309 ntTSL 510.93□□□□□ -0.661e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 83.9
DKC1O60832 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 83.9
DKC1O60832 RNA5-8SP6-201ENST00000515896 152 ntBASIC11.68□□□□□ -0.541e-18■■■■■ 83.7
DKC1O60832 VAV2-205ENST00000486113 523 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 83.4
DKC1O60832 CCT6A-205ENST00000466572 686 ntTSL 213.7□□□□□ -0.222e-11■■■■■ 83.1
DKC1O60832 CCT6A-207ENST00000492618 692 ntTSL 311.73□□□□□ -0.532e-11■■■■■ 83.1
DKC1O60832 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 83
DKC1O60832 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.792e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.722e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.72e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.612e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 522.91■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-207ENST00000484499 924 ntTSL 510.65□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 EIF4A2-223ENST00000494445 629 ntTSL 29.99□□□□□ -0.811e-323■■■■■ 82.3
DKC1O60832 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.583e-18■■■■■ 81.5
DKC1O60832 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.373e-18■■■■■ 81.5
DKC1O60832 EPB41L4A-AS1-202ENST00000427306 1367 ntTSL 226.54■■□□□ 1.841e-323■■■■■ 81.5
DKC1O60832 EPB41L4A-AS1-203ENST00000442823 578 ntTSL 219.54■□□□□ 0.721e-323■■■■■ 81.5
DKC1O60832 EPB41L4A-AS1-204ENST00000508590 292 ntTSL 317.89■□□□□ 0.451e-323■■■■■ 81.5
DKC1O60832 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.241e-323■■■■■ 81.5
DKC1O60832 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.591e-323■■■■■ 81.5
DKC1O60832 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.347e-7■■■■■ 81.4
DKC1O60832 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.317e-7■■■■■ 81.4
Retrieved 100 of 8,567 protein–RNA pairs in 224.3 ms