Protein–RNA interactions for Protein: O60688

YPEL1, Protein yippee-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL1O60688 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YPEL1O60688 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YPEL1O60688 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YPEL1O60688 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
YPEL1O60688 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms