Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM1AO60341 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM1AO60341 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM1AO60341 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM1AO60341 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1AO60341 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM1AO60341 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms