Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CREB3O43889 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CREB3O43889 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CREB3O43889 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CREB3O43889 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CREB3O43889 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CREB3O43889 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CREB3O43889 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CREB3O43889 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CREB3O43889 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CREB3O43889 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CREB3O43889 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CREB3O43889 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CREB3O43889 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CREB3O43889 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CREB3O43889 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CREB3O43889 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CREB3O43889 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB3O43889 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB3O43889 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB3O43889 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CREB3O43889 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CREB3O43889 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CREB3O43889 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CREB3O43889 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CREB3O43889 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CREB3O43889 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CREB3O43889 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CREB3O43889 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CREB3O43889 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CREB3O43889 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CREB3O43889 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CREB3O43889 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CREB3O43889 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CREB3O43889 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CREB3O43889 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CREB3O43889 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CREB3O43889 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CREB3O43889 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CREB3O43889 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CREB3O43889 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3O43889 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3O43889 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CREB3O43889 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CREB3O43889 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CREB3O43889 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CREB3O43889 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3O43889 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3O43889 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3O43889 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB3O43889 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB3O43889 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB3O43889 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3O43889 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3O43889 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3O43889 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3O43889 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB3O43889 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CREB3O43889 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CREB3O43889 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CREB3O43889 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CREB3O43889 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREB3O43889 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREB3O43889 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREB3O43889 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CREB3O43889 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3O43889 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3O43889 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3O43889 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3O43889 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3O43889 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREB3O43889 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CREB3O43889 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CREB3O43889 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CREB3O43889 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CREB3O43889 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREB3O43889 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREB3O43889 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREB3O43889 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREB3O43889 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CREB3O43889 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREB3O43889 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREB3O43889 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREB3O43889 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREB3O43889 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CREB3O43889 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3O43889 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREB3O43889 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3O43889 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3O43889 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3O43889 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3O43889 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREB3O43889 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3O43889 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3O43889 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3O43889 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREB3O43889 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3O43889 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3O43889 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREB3O43889 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms