Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD6O43541 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD6O43541 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD6O43541 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD6O43541 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMAD6O43541 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAD6O43541 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms