Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF12O43508 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12O43508 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF12O43508 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF12O43508 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12O43508 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF12O43508 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms