Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PIK3CDO00329 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PIK3CDO00329 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PIK3CDO00329 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PIK3CDO00329 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3CDO00329 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3CDO00329 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIK3CDO00329 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIK3CDO00329 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIK3CDO00329 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PIK3CDO00329 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PIK3CDO00329 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
PIK3CDO00329 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PIK3CDO00329 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PIK3CDO00329 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PIK3CDO00329 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PIK3CDO00329 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PIK3CDO00329 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PIK3CDO00329 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PIK3CDO00329 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PIK3CDO00329 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PIK3CDO00329 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PIK3CDO00329 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PIK3CDO00329 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms