Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD9O00233 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD9O00233 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD9O00233 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD9O00233 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD9O00233 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD9O00233 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD9O00233 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD9O00233 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD9O00233 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD9O00233 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD9O00233 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD9O00233 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD9O00233 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms