Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAPO00193 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAPO00193 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAPO00193 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMAPO00193 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMAPO00193 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMAPO00193 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMAPO00193 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMAPO00193 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMAPO00193 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAPO00193 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAPO00193 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAPO00193 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAPO00193 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAPO00193 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAPO00193 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAPO00193 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAPO00193 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAPO00193 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAPO00193 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAPO00193 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAPO00193 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAPO00193 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMAPO00193 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAPO00193 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAPO00193 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAPO00193 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAPO00193 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAPO00193 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAPO00193 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAPO00193 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAPO00193 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAPO00193 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAPO00193 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAPO00193 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAPO00193 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAPO00193 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAPO00193 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAPO00193 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMAPO00193 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAPO00193 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMAPO00193 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAPO00193 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMAPO00193 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SMAPO00193 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMAPO00193 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMAPO00193 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAPO00193 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAPO00193 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMAPO00193 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMAPO00193 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAPO00193 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAPO00193 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAPO00193 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAPO00193 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAPO00193 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAPO00193 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAPO00193 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAPO00193 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAPO00193 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAPO00193 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAPO00193 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAPO00193 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAPO00193 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAPO00193 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAPO00193 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAPO00193 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAPO00193 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAPO00193 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAPO00193 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMAPO00193 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMAPO00193 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAPO00193 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAPO00193 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAPO00193 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAPO00193 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAPO00193 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAPO00193 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAPO00193 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAPO00193 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAPO00193 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAPO00193 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAPO00193 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAPO00193 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAPO00193 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAPO00193 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAPO00193 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAPO00193 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAPO00193 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAPO00193 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAPO00193 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAPO00193 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAPO00193 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAPO00193 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAPO00193 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAPO00193 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAPO00193 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAPO00193 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAPO00193 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMAPO00193 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms