Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGPSO00116 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGPSO00116 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGPSO00116 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGPSO00116 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGPSO00116 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGPSO00116 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
AGPSO00116 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AGPSO00116 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AGPSO00116 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AGPSO00116 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AGPSO00116 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AGPSO00116 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AGPSO00116 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AGPSO00116 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AGPSO00116 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AGPSO00116 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AGPSO00116 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AGPSO00116 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AGPSO00116 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGPSO00116 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AGPSO00116 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AGPSO00116 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGPSO00116 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGPSO00116 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGPSO00116 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGPSO00116 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGPSO00116 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGPSO00116 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGPSO00116 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGPSO00116 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGPSO00116 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGPSO00116 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGPSO00116 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AGPSO00116 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGPSO00116 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGPSO00116 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGPSO00116 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGPSO00116 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGPSO00116 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGPSO00116 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGPSO00116 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGPSO00116 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGPSO00116 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGPSO00116 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGPSO00116 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AGPSO00116 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGPSO00116 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGPSO00116 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGPSO00116 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGPSO00116 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AGPSO00116 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGPSO00116 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGPSO00116 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGPSO00116 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGPSO00116 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGPSO00116 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGPSO00116 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
AGPSO00116 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGPSO00116 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGPSO00116 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGPSO00116 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGPSO00116 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGPSO00116 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGPSO00116 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGPSO00116 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGPSO00116 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGPSO00116 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGPSO00116 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGPSO00116 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGPSO00116 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGPSO00116 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGPSO00116 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGPSO00116 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGPSO00116 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
AGPSO00116 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGPSO00116 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGPSO00116 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGPSO00116 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGPSO00116 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGPSO00116 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGPSO00116 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGPSO00116 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGPSO00116 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGPSO00116 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AGPSO00116 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPSO00116 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPSO00116 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPSO00116 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGPSO00116 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGPSO00116 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGPSO00116 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGPSO00116 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGPSO00116 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGPSO00116 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGPSO00116 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGPSO00116 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGPSO00116 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGPSO00116 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
AGPSO00116 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms