Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H7C417 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
H7C417 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H7C417 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H7C417 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C417 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C417 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C417 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C417 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C417 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C417 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C417 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C417 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C417 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C417 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C417 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C417 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C417 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C417 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C417 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C417 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C417 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C417 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C417 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C417 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C417 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C417 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C417 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C417 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C417 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C417 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C417 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C417 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C417 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C417 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C417 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C417 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C417 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C417 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C417 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C417 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C417 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C417 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C417 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C417 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C417 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C417 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C417 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C417 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C417 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C417 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C417 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C417 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C417 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
H7C417 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H7C417 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C417 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H7C417 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H7C417 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C417 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C417 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H7C417 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C417 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C417 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C417 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C417 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C417 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C417 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C417 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C417 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C417 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C417 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C417 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C417 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C417 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C417 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C417 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H7C417 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C417 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H7C417 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C417 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C417 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C417 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H7C417 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C417 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C417 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C417 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H7C417 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C417 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C417 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H7C417 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C417 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C417 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H7C417 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C417 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C417 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C417 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C417 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C417 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C417 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms