Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BQF6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BQF6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BQF6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BQF6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BQF6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BQF6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BQF6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BQF6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BQF6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BQF6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
H3BQF6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BQF6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H3BQF6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H3BQF6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQF6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQF6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQF6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BQF6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BQF6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BQF6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
H3BQF6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
H3BQF6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H3BQF6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
H3BQF6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BQF6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H3BQF6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H3BQF6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
H3BQF6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BQF6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BQF6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BQF6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BQF6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BQF6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BQF6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
H3BQF6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H3BQF6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H3BQF6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H3BQF6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H3BQF6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
H3BQF6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H3BQF6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
H3BQF6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H3BQF6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H3BQF6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H3BQF6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H3BQF6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H3BQF6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H3BQF6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H3BQF6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
H3BQF6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
H3BQF6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
H3BQF6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
H3BQF6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H3BQF6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H3BQF6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
H3BQF6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H3BQF6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H3BQF6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H3BQF6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H3BQF6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H3BQF6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H3BQF6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H3BQF6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BQF6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BQF6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BQF6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BQF6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H3BQF6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
H3BQF6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H3BQF6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BQF6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BQF6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BQF6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BQF6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BQF6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQF6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQF6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQF6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BQF6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BQF6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BQF6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BQF6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BQF6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BQF6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H3BQF6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H3BQF6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BQF6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BQF6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQF6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQF6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BQF6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQF6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQF6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BQF6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H3BQF6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H3BQF6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BQF6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BQF6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BQF6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms