Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC2LH3BP13 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC2LH3BP13 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC2LH3BP13 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2LH3BP13 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC2LH3BP13 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms