Protein–RNA interactions for Protein: F5H4A9

C3orf80, Uncharacterized membrane protein C3orf80, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf80F5H4A9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf80F5H4A9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf80F5H4A9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf80F5H4A9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf80F5H4A9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf80F5H4A9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf80F5H4A9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf80F5H4A9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf80F5H4A9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf80F5H4A9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf80F5H4A9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf80F5H4A9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf80F5H4A9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C3orf80F5H4A9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf80F5H4A9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms