Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIF28PB7ZC32 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
KIF28PB7ZC32 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIF28PB7ZC32 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIF28PB7ZC32 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIF28PB7ZC32 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIF28PB7ZC32 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KIF28PB7ZC32 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KIF28PB7ZC32 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KIF28PB7ZC32 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIF28PB7ZC32 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIF28PB7ZC32 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
KIF28PB7ZC32 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KIF28PB7ZC32 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIF28PB7ZC32 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
KIF28PB7ZC32 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIF28PB7ZC32 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms