Protein–RNA interactions for Protein: A8MXK1

VSTM5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM5A8MXK1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM5A8MXK1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSTM5A8MXK1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM5A8MXK1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM5A8MXK1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM5A8MXK1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSTM5A8MXK1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM5A8MXK1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms