Protein–RNA interactions for Protein: A8MV72

Putative UPF0607 protein ENSP00000382826, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MV72 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A8MV72 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A8MV72 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A8MV72 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A8MV72 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A8MV72 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A8MV72 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A8MV72 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A8MV72 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A8MV72 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A8MV72 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A8MV72 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A8MV72 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A8MV72 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A8MV72 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A8MV72 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A8MV72 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A8MV72 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A8MV72 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A8MV72 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A8MV72 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A8MV72 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A8MV72 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A8MV72 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A8MV72 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A8MV72 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A8MV72 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A8MV72 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A8MV72 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A8MV72 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A8MV72 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A8MV72 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A8MV72 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A8MV72 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A8MV72 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MV72 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MV72 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MV72 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MV72 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MV72 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A8MV72 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MV72 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MV72 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MV72 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A8MV72 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A8MV72 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A8MV72 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A8MV72 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A8MV72 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A8MV72 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A8MV72 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A8MV72 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A8MV72 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A8MV72 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A8MV72 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
A8MV72 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A8MV72 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A8MV72 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A8MV72 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A8MV72 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A8MV72 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A8MV72 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A8MV72 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A8MV72 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A8MV72 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A8MV72 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A8MV72 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A8MV72 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A8MV72 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A8MV72 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A8MV72 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A8MV72 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A8MV72 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A8MV72 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A8MV72 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A8MV72 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A8MV72 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A8MV72 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A8MV72 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A8MV72 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A8MV72 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A8MV72 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MV72 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MV72 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MV72 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MV72 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MV72 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A8MV72 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MV72 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A8MV72 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A8MV72 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A8MV72 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A8MV72 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A8MV72 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A8MV72 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A8MV72 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A8MV72 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A8MV72 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A8MV72 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A8MV72 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms