Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms