Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZK1P1A8MUH7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZK1P1A8MUH7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZK1P1A8MUH7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1P1A8MUH7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZK1P1A8MUH7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZK1P1A8MUH7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms