Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP27XA6NNY8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP27XA6NNY8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP27XA6NNY8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP27XA6NNY8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP27XA6NNY8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP27XA6NNY8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP27XA6NNY8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP27XA6NNY8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP27XA6NNY8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP27XA6NNY8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP27XA6NNY8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP27XA6NNY8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP27XA6NNY8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP27XA6NNY8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
USP27XA6NNY8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP27XA6NNY8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP27XA6NNY8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP27XA6NNY8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
USP27XA6NNY8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP27XA6NNY8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP27XA6NNY8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP27XA6NNY8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP27XA6NNY8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms