Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIIAD1A6NNX1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms