Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCT8L1PA6NM43 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCT8L1PA6NM43 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCT8L1PA6NM43 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCT8L1PA6NM43 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCT8L1PA6NM43 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8L1PA6NM43 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8L1PA6NM43 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8L1PA6NM43 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT8L1PA6NM43 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT8L1PA6NM43 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCT8L1PA6NM43 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCT8L1PA6NM43 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCT8L1PA6NM43 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT8L1PA6NM43 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCT8L1PA6NM43 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms