Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBAL3A6NHL2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBAL3A6NHL2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBAL3A6NHL2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBAL3A6NHL2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBAL3A6NHL2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBAL3A6NHL2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms