Protein–RNA interactions for Protein: A6NGS2

ERICH4, Glutamate-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERICH4A6NGS2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERICH4A6NGS2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERICH4A6NGS2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERICH4A6NGS2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERICH4A6NGS2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERICH4A6NGS2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ERICH4A6NGS2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERICH4A6NGS2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ERICH4A6NGS2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERICH4A6NGS2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERICH4A6NGS2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERICH4A6NGS2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERICH4A6NGS2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERICH4A6NGS2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERICH4A6NGS2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERICH4A6NGS2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERICH4A6NGS2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERICH4A6NGS2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERICH4A6NGS2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERICH4A6NGS2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERICH4A6NGS2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERICH4A6NGS2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERICH4A6NGS2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERICH4A6NGS2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERICH4A6NGS2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms