Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGPEP1LA6NFU8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGPEP1LA6NFU8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGPEP1LA6NFU8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGPEP1LA6NFU8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGPEP1LA6NFU8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms