Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBFOX3A6NFN3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBFOX3A6NFN3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBFOX3A6NFN3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBFOX3A6NFN3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBFOX3A6NFN3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBFOX3A6NFN3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms