Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP17L3A6NCW0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
USP17L3A6NCW0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP17L3A6NCW0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP17L3A6NCW0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP17L3A6NCW0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
USP17L3A6NCW0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
USP17L3A6NCW0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
USP17L3A6NCW0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
USP17L3A6NCW0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP17L3A6NCW0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP17L3A6NCW0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP17L3A6NCW0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
USP17L3A6NCW0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP17L3A6NCW0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP17L3A6NCW0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP17L3A6NCW0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP17L3A6NCW0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP17L3A6NCW0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP17L3A6NCW0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP17L3A6NCW0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP17L3A6NCW0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
USP17L3A6NCW0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
USP17L3A6NCW0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
USP17L3A6NCW0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP17L3A6NCW0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP17L3A6NCW0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP17L3A6NCW0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP17L3A6NCW0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP17L3A6NCW0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP17L3A6NCW0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP17L3A6NCW0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP17L3A6NCW0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP17L3A6NCW0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP17L3A6NCW0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP17L3A6NCW0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP17L3A6NCW0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L3A6NCW0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L3A6NCW0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L3A6NCW0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L3A6NCW0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP17L3A6NCW0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP17L3A6NCW0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP17L3A6NCW0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms