Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT87PA6NCN2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT87PA6NCN2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT87PA6NCN2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT87PA6NCN2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT87PA6NCN2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms