Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM72A0PK05 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM72A0PK05 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM72A0PK05 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM72A0PK05 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM72A0PK05 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms