Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQW1

LOC100506127, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC100506127A0A0U1RQW1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LOC100506127A0A0U1RQW1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LOC100506127A0A0U1RQW1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LOC100506127A0A0U1RQW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LOC100506127A0A0U1RQW1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LOC100506127A0A0U1RQW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LOC100506127A0A0U1RQW1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LOC100506127A0A0U1RQW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms